企业在办理银行保函时，可以通过自己的基本户银行或者有授信的银行办理，由于我国很多银行并不提供保函办理业务，对于这一类的企业，可以选择担保公司进行办理，目前国内的担保公司可以代办国内的银行保函，有实力的担保公司还可以做到免保证金办理。
在工程项目的合同签订时，常常会有如下要求：“履约保证金在收到中标通知书后，成交供应商应按合同规定向采购人提交履约保证金，可采用银行保函的形式。”
那这里说的银行保函是什么意思呢？这里的银行保函是指银行履约保函，作用是替代履约保证金。履约保证金是指在合同签订时，为避免乙方不能够按照合同要求进行工程实施时，则由银行向甲方支付赔偿金。
预付款保函风险有哪些?
预付款保函：按国际工程承包的例行做法，合同生效一个月内，业主应向承包商预付一笔款额，通常合同总额的10-15%，由于是预付，承包商必须在合同的中期或后期偿还，通常是由工程进度款中扣回。为保证承包商能如数偿还这项预付款，业主要求承包商的银行出具等额的担保函。由于付款的偿还是分批扣还，而预付款保函则是一次性开出，如果保函中未曾写明预付款保函的担保金额，将随保函归还金额而相应减少，则很可能出现预付款已大部分偿还，而保函额不减的局面，业主随时可能全额没收保函，而承包商却不拥有全额预付款(因为很可能在业主没收保函时，承包商已经偿还了部分预付款)。预付款保函的另一个风险是保函的生效时间先于承包商收到的预付款，承包商在不知情的前提下，业主已经没收预付款保函而承包商未收到预付款。还有一种可能的风险，就是预付款已经扣还完毕，而预付款保函没有及时撤销，让业主有机可乘，留下没收保函之机。
预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。